Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revisionPrevious revision
teaching:perles [2016/11/09 22:46] – lamboringoteaching:perles [2017/01/30 13:57] (current) – lamboringo
Line 1: Line 1:
 {{tag>teaching:Teaching}} {{tag>teaching:Teaching}}
  
-# Bioanalyse+=== Bioanalyse ===
  
-- cette protéine est un plasmide de 75Kbp +  * cette protéine est un plasmide de 75Kbp 
-- Les séquences divergentes représentent des séquences qui sont éloignées au cours des temps géologiques +  * Les séquences divergentes représentent des séquences qui sont éloignées au cours des temps géologiques 
-- Un BLAST avec la séquence nucléaire +  * Un BLAST avec la séquence nucléaire 
-- le numéro des matrices (ndlr: de substitution) représentent la fixation d'acides aminés dans une population et donc la distance évolutive. +  * le numéro des matrices (ndlr: de substitution) représentent la fixation d'acides aminés dans une population et donc la distance évolutive. 
-- Swissprot permet d'obtenir une fiche de renseignements plus lisibles avec les différentes parties écrites en toute lettre. +  * Swissprot permet d'obtenir une fiche de renseignements plus lisibles avec les différentes parties écrites en toute lettre. 
-- Le signe + indique que pour cet position, l'acide aminé peut varier donc les deux acides aminés sont positifs. +  * Le signe + indique que pour cet position, l'acide aminé peut varier donc les deux acides aminés sont positifs. 
-- La question posée, traduite en langage humain est, la suivante "... +  * La question posée, traduite en langage humain est, la suivante "... 
-- On qualifie 2 gènes d'homologues si leur diversité diverge d'une séquence ancestrale commune. [...] Ainsi, 2 gènes appartenant à une famille multigénique peuvent être qualifiés de paralogues ou d'orthologues. +  * On qualifie 2 gènes d'homologues si leur diversité diverge d'une séquence ancestrale commune. [...] Ainsi, 2 gènes appartenant à une famille multigénique peuvent être qualifiés de paralogues ou d'orthologues. 
-- Dans le cas contraire on prendra l'inverse. +  * Dans le cas contraire on prendra l'inverse. 
-- Question: Le lotus est-il une monocotylédone ? Réponse: Non, il s'agit d'une molécule d'ADN génomique, ... +  * Question: Le lotus est-il une monocotylédone ? Réponse: Non, il s'agit d'une molécule d'ADN génomique, ... 
-- L'ARNm est le gène sans ses exons. +  * L'ARNm est le gène sans ses exons. 
-- EMBL est une banque de données généraliste européenne des séquences nucléaires maintenue sur l'EBI. +  * EMBL est une banque de données généraliste européenne des séquences nucléaires maintenue sur l'EBI. 
-- Le lotus est une monocotylédone car noté eudicotylédone...+  * Le lotus est une monocotylédone car noté eudicotylédone...
  
-# Annotation+=== Annotation ===
  
-- Pour le brin complémentaire, on observe les même similitude de différences que pour le brin direct.+  * Pour le brin complémentaire, on observe les même similitude de différences que pour le brin direct.
  
-# Fouille de données+=== Fouille de données ===
  
-- Les paramètres sont évaluables grâce à des critères d'erreurs que l'on peut intégrer dans le processus d'un classificateur ou d'une méthode, qui évalue l'erreur liée à la méthode. +  * Les paramètres sont évaluables grâce à des critères d'erreurs que l'on peut intégrer dans le processus d'un classificateur ou d'une méthode, qui évalue l'erreur liée à la méthode. 
-- La normalisation évite qu'il y ait des différences de distance entre les données, cela permet de trouver des distances fiables.+  * La normalisation évite qu'il y ait des différences de distance entre les données, cela permet de trouver des distances fiables.
  
-# Traitement de données biologiques+=== Traitement de données biologiques ===
  
-- La différence entre le réplicat biologique et technique est que le réplicat biologique est issu d'espèces non génétiquement modifiées alors que le technique est issu d'espèces génétiquement modifiées. +  * La différence entre le réplicat biologique et technique est que le réplicat biologique est issu d'espèces non génétiquement modifiées alors que le technique est issu d'espèces génétiquement modifiées. 
-- Un réplicat biologique utilise 2 génomes différents pour la construction de la puce. +  * Un réplicat biologique utilise 2 génomes différents pour la construction de la puce. 
-- Le graphique de volcano est obtenu par comparaison de la transcription de différents gènes à un moment donné et donc de la comparaison de la quantité d'ARNm d'une protéine. +  * Le graphique de volcano est obtenu par comparaison de la transcription de différents gènes à un moment donné et donc de la comparaison de la quantité d'ARNm d'une protéine. 
-- Pourquoi effectuer des répétitions ? de quelle nature peuvent-elles être et que permettent-elles d’estimer ?  +  * Pourquoi effectuer des répétitions ? de quelle nature peuvent-elles être et que permettent-elles d’estimer ?  
-: Pour pouvoir comparer l'expression de gènes. On fait des répétitions ce qui nous permettra de voir les gènes co-exprimés. Elle est de nature protéiques et nous permet d'estimer la moyenne de chacune des séquences analysée. +    * Pour pouvoir comparer l'expression de gènes. On fait des répétitions ce qui nous permettra de voir les gènes co-exprimés. Elle est de nature protéiques et nous permet d'estimer la moyenne de chacune des séquences analysée. 
-- Un réplicat biologique est un gène impliqué dans une maladie que l'on retrouve chez plusieurs patients.+  * Un réplicat biologique est un gène impliqué dans une maladie que l'on retrouve chez plusieurs patients.