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| # Bioanalyse | === Bioanalyse === |
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| - cette protéine est un plasmide de 75Kbp | * cette protéine est un plasmide de 75Kbp |
| - Les séquences divergentes représentent des séquences qui sont éloignées au cours des temps géologiques | * Les séquences divergentes représentent des séquences qui sont éloignées au cours des temps géologiques |
| - Un BLAST avec la séquence nucléaire | * Un BLAST avec la séquence nucléaire |
| - le numéro des matrices (ndlr: de substitution) représentent la fixation d'acides aminés dans une population et donc la distance évolutive. | * le numéro des matrices (ndlr: de substitution) représentent la fixation d'acides aminés dans une population et donc la distance évolutive. |
| - Swissprot permet d'obtenir une fiche de renseignements plus lisibles avec les différentes parties écrites en toute lettre. | * Swissprot permet d'obtenir une fiche de renseignements plus lisibles avec les différentes parties écrites en toute lettre. |
| - Le signe + indique que pour cet position, l'acide aminé peut varier donc les deux acides aminés sont positifs. | * Le signe + indique que pour cet position, l'acide aminé peut varier donc les deux acides aminés sont positifs. |
| - La question posée, traduite en langage humain est, la suivante "... | * La question posée, traduite en langage humain est, la suivante "... |
| - On qualifie 2 gènes d'homologues si leur diversité diverge d'une séquence ancestrale commune. [...] Ainsi, 2 gènes appartenant à une famille multigénique peuvent être qualifiés de paralogues ou d'orthologues. | * On qualifie 2 gènes d'homologues si leur diversité diverge d'une séquence ancestrale commune. [...] Ainsi, 2 gènes appartenant à une famille multigénique peuvent être qualifiés de paralogues ou d'orthologues. |
| - Dans le cas contraire on prendra l'inverse. | * Dans le cas contraire on prendra l'inverse. |
| - Question: Le lotus est-il une monocotylédone ? Réponse: Non, il s'agit d'une molécule d'ADN génomique, ... | * Question: Le lotus est-il une monocotylédone ? Réponse: Non, il s'agit d'une molécule d'ADN génomique, ... |
| - L'ARNm est le gène sans ses exons. | * L'ARNm est le gène sans ses exons. |
| - EMBL est une banque de données généraliste européenne des séquences nucléaires maintenue sur l'EBI. | * EMBL est une banque de données généraliste européenne des séquences nucléaires maintenue sur l'EBI. |
| - Le lotus est une monocotylédone car noté eudicotylédone... | * Le lotus est une monocotylédone car noté eudicotylédone... |
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| # Annotation | === Annotation === |
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| - Pour le brin complémentaire, on observe les même similitude de différences que pour le brin direct. | * Pour le brin complémentaire, on observe les même similitude de différences que pour le brin direct. |
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| # Fouille de données | === Fouille de données === |
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| - Les paramètres sont évaluables grâce à des critères d'erreurs que l'on peut intégrer dans le processus d'un classificateur ou d'une méthode, qui évalue l'erreur liée à la méthode. | * Les paramètres sont évaluables grâce à des critères d'erreurs que l'on peut intégrer dans le processus d'un classificateur ou d'une méthode, qui évalue l'erreur liée à la méthode. |
| - La normalisation évite qu'il y ait des différences de distance entre les données, cela permet de trouver des distances fiables. | * La normalisation évite qu'il y ait des différences de distance entre les données, cela permet de trouver des distances fiables. |
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| # Traitement de données biologiques | === Traitement de données biologiques === |
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| - La différence entre le réplicat biologique et technique est que le réplicat biologique est issu d'espèces non génétiquement modifiées alors que le technique est issu d'espèces génétiquement modifiées. | * La différence entre le réplicat biologique et technique est que le réplicat biologique est issu d'espèces non génétiquement modifiées alors que le technique est issu d'espèces génétiquement modifiées. |
| - Un réplicat biologique utilise 2 génomes différents pour la construction de la puce. | * Un réplicat biologique utilise 2 génomes différents pour la construction de la puce. |
| - Le graphique de volcano est obtenu par comparaison de la transcription de différents gènes à un moment donné et donc de la comparaison de la quantité d'ARNm d'une protéine. | * Le graphique de volcano est obtenu par comparaison de la transcription de différents gènes à un moment donné et donc de la comparaison de la quantité d'ARNm d'une protéine. |
| - Pourquoi effectuer des répétitions ? de quelle nature peuvent-elles être et que permettent-elles d’estimer ? | * Pourquoi effectuer des répétitions ? de quelle nature peuvent-elles être et que permettent-elles d’estimer ? |
| : Pour pouvoir comparer l'expression de gènes. On fait des répétitions ce qui nous permettra de voir les gènes co-exprimés. Elle est de nature protéiques et nous permet d'estimer la moyenne de chacune des séquences analysée. | * Pour pouvoir comparer l'expression de gènes. On fait des répétitions ce qui nous permettra de voir les gènes co-exprimés. Elle est de nature protéiques et nous permet d'estimer la moyenne de chacune des séquences analysée. |
| - Un réplicat biologique est un gène impliqué dans une maladie que l'on retrouve chez plusieurs patients. | * Un réplicat biologique est un gène impliqué dans une maladie que l'on retrouve chez plusieurs patients. |
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